192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0518 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0518  twin arginine-targeting protein translocase  100 
 
 		 77 aa  153  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  60.27 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  53.33 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  54.67 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3420  twin arginine-targeting protein translocase  54.79 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.984089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  47.76 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  50.67 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  50.67 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  50.67 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  50.67 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  50.67 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  56.16 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  65.45 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  63.16 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  53.25 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.25 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1041  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.67 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  53.25 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  53.25 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  53.25 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  53.25 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  53.25 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  53.25 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  53.25 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  61.4 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  45.12 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  65.45 
 
 		 85 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  65.45 
 
 		 85 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  48 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  56.52 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  61.4 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  50.67 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  63.46 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1082  twin arginine-targeting protein translocase  61.02 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  61.4 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.4 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  45.59 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1038  twin arginine-targeting protein translocase  69.81 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  45.59 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  45.59 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  67.27 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4185  twin arginine-targeting protein translocase  59.65 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  42.67 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  42.67 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3760  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.18 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  51.9 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  51.25 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  49.25 
 
 		 82 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  48.65 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  63.16 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  45 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0593  twin arginine-targeting protein translocase  49.3 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0778682  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  42.47 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5807  twin arginine translocase protein A  61.9 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66960  twin arginine translocase protein A  61.9 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.71 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  44.3 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  61.22 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0258  twin arginine translocase protein A  43.66 
 
 		 72 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0612508  hitchhiker  0.00415205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  48.48 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0251  twin arginine-targeting protein translocase  53.23 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.293668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  44.3 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3058  twin-arginine translocation protein TatA/E  54.43 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1180  twin arginine translocase protein A  41.98 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0449  twin arginine translocase protein A  47.78 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  45.59 
 
 		 73 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  41.89 
 
 		 73 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  41.56 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0219  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.85 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45460  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5066  twin arginine translocase protein A  47.78 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0458  twin arginine-targeting protein translocase  54.55 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4890  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5016  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3157  twin arginine translocase protein A  58 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000988339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3942  twin arginine-targeting protein translocase  53.85 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2971  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.85 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00309368  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3638  Sec-independent protein translocase protein TatA  53.85 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0274  twin arginine-targeting protein translocase TatA  53.85 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0743  twin arginine-targeting protein translocase  53.42 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2956  twin arginine translocase protein A  41.43 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1856  twin arginine translocase protein A  41.43 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000816668  normal  0.827039 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>