14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3145 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3145  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  455  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0842  hypothetical protein  40.7 
 
 
215 aa  159  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0530  hypothetical protein  40.31 
 
 
200 aa  152  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000151796  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0193  hypothetical protein  38.19 
 
 
217 aa  149  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20900  hypothetical protein  38.54 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3401  hypothetical protein  41.52 
 
 
209 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5577  von Willebrand factor type A  37.61 
 
 
215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1718  von Willebrand factor type A  39.15 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1750  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.03 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.161961  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0724  hypothetical protein  32.81 
 
 
240 aa  97.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255555  normal  0.0372103 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0762  von Willebrand factor type A  32.47 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.915721  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1694  hypothetical protein  34.57 
 
 
122 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.299884  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.67 
 
 
442 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5886  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  hitchhiker  0.00718137 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>