13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3401 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3401  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1718  von Willebrand factor type A  68.78 
 
 
211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0842  hypothetical protein  41.05 
 
 
215 aa  145  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5577  von Willebrand factor type A  41.18 
 
 
215 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3145  hypothetical protein  41.52 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0530  hypothetical protein  37.82 
 
 
200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000151796  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20900  hypothetical protein  37.57 
 
 
216 aa  125  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0193  hypothetical protein  35.35 
 
 
217 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1750  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.89 
 
 
231 aa  114  8.999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.161961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0762  von Willebrand factor type A  34.2 
 
 
233 aa  99  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.915721  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0724  hypothetical protein  33.02 
 
 
240 aa  92.8  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255555  normal  0.0372103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1694  hypothetical protein  41.07 
 
 
122 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.299884  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  31.5 
 
 
543 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>