16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1750 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1750  von Willebrand factor type A domain-containing protein  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.161961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0193  hypothetical protein  53.41 
 
 
217 aa  188  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20900  hypothetical protein  45.63 
 
 
216 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0762  von Willebrand factor type A  44.72 
 
 
233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.915721  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0842  hypothetical protein  42.77 
 
 
215 aa  135  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0724  hypothetical protein  42.42 
 
 
240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.255555  normal  0.0372103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5577  von Willebrand factor type A  38.46 
 
 
215 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0530  hypothetical protein  38.76 
 
 
200 aa  122  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000151796  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3145  hypothetical protein  35.03 
 
 
223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3401  hypothetical protein  33.89 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1718  von Willebrand factor type A  37.36 
 
 
211 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1694  hypothetical protein  38.78 
 
 
122 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.299884  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5886  hypothetical protein  41.67 
 
 
110 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916767  hitchhiker  0.00718137 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  25 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.68 
 
 
412 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>