More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0123 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
396 aa  807    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1148  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.68 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0982  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.68 
 
 
382 aa  90.1  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000253435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 
289 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.51 
 
 
165 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.69 
 
 
217 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0546  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.03 
 
 
415 aa  86.3  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3222  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.51 
 
 
165 aa  86.3  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.53 
 
 
205 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.27 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.9 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.66 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.47 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0647  hypothetical protein  34.15 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0072  hypothetical protein  38.21 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3616  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32 
 
 
156 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4858  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.09 
 
 
153 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.66 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1637  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.64 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000221895  hitchhiker  0.00347843 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4743  hypothetical protein  37.27 
 
 
153 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4762  hypothetical protein  37.27 
 
 
153 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5172  hypothetical protein  37.27 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4899  hypothetical protein  37.27 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5274  hypothetical protein  37.27 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5143  hypothetical protein  37.27 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5178  hypothetical protein  37.27 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5187  hypothetical protein  37.27 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4450  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.15 
 
 
190 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.04 
 
 
217 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4055  hypothetical protein  38.68 
 
 
186 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3901  erfK/srfK protein  38.68 
 
 
186 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00361052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4372  hypothetical protein  38.68 
 
 
186 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4170  hypothetical protein  38.68 
 
 
186 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0975  hypothetical protein  39.62 
 
 
186 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0886923  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4260  hypothetical protein  39.62 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  34.75 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  34.75 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  34.75 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2287  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.38 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4281  hypothetical protein  38.68 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0049222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4221  hypothetical protein  38.68 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00480298  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.75 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1457  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG protein family protein  29.55 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000050747  normal  0.073975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.45 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0656  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.75 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.35 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0825  hypothetical protein  34.75 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2602e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3894  ErfK/SrfK protein  37.74 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000648074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3989  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.68 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1274  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.45 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.88 
 
 
215 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.33235  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.8 
 
 
224 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0706  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG domain-containing protein  28.36 
 
 
197 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4246  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.52 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4697  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36 
 
 
224 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0835735  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0360  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.37 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.46 
 
 
175 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.502395  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5407  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.25 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831337  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.04 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363302  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5602  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.62 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31169  normal  0.82128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0668  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.9 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.8 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322288  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3014  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.5 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1933  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.92 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147149  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.64 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.85 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.644821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.32 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0320  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.79 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.570438  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4451  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.62 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3017  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.04 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1053  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.7 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6654  hypothetical protein  34.35 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21355 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2845  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.71 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0165  hypothetical protein  38.05 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.526923  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3329  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.11 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0184  hypothetical protein  37.17 
 
 
244 aa  69.3  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.2 
 
 
253 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2026  hypothetical protein  32.12 
 
 
303 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6213  hypothetical protein  35.78 
 
 
231 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3529  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.35 
 
 
199 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70668  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3653  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.11 
 
 
199 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0806  hypothetical protein  36.89 
 
 
219 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0927  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.65 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000328138  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0434  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.29 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.19 
 
 
196 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.740038  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2196  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.95 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4362  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.78 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00426459  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0190  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.61 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0593076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3650  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.81 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.016263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0501  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.25 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0210  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.65 
 
 
175 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.521298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.1 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21380  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.09 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0304  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.27 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.06 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1136  hypothetical protein  36.67 
 
 
237 aa  67  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.96 
 
 
187 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0540206  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1095  hypothetical protein  37.07 
 
 
255 aa  67  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.94 
 
 
232 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>