28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_R0017 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_R0017  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544015  hitchhiker  0.0000175042 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0025  tRNA-Ser  92.22 
 
 		 90 bp  117  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0031  tRNA-Ser  94.19 
 
 		 89 bp  117  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.137848  normal  0.0108409 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0030  tRNA-Ser  85 
 
 		 101 bp  95.6  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.329697  hitchhiker  0.00107888 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0033  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 89 bp  85.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0030  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 88 bp  79.8  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 98 bp  79.8  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0008  tRNA-OTHER  90.16 
 
 		 110 bp  73.8  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.245868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0008  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 98 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00454198  hitchhiker  6.07507e-16 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0043  tRNA-OTHER  100 
 
 		 102 bp  67.9  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.049603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0021  tRNA-Ser  92 
 
 		 104 bp  67.9  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.595381 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0036  tRNA-Arg  92 
 
 		 123 bp  67.9  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 100 bp  67.9  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 103 bp  67.9  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0003  tRNA-OTHER  97.14 
 
 		 103 bp  61.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0822351  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  58  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0029  tRNA-OTHER  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0018  tRNA-OTHER  100 
 
 		 110 bp  54  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0018  tRNA-Ser  84.27 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0150168  hitchhiker  0.0000162071 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  100 
 
 		 109 bp  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0030  tRNA-Ser  84.27 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0031  tRNA-Ser  83.72 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.334076  hitchhiker  0.00102641 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0005  tRNA-Phe  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0040  tRNA-Phe  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.738588 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0014  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0023  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.135769  normal  0.832903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>