15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_R0003 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_R0003  tRNA-OTHER  100 
 
 		 103 bp  204  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0822351  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0029  tRNA-OTHER  96 
 
 		 117 bp  83.8  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0030  tRNA-Ser  94.34 
 
 		 88 bp  81.8  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0018  tRNA-OTHER  95.45 
 
 		 110 bp  71.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0030  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 101 bp  65.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.329697  hitchhiker  0.00107888 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0014  tRNA-Ser  97.22 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00454198  hitchhiker  6.07507e-16 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0025  tRNA-Ser  97.22 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0033  tRNA-Ser  97.22 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0017  tRNA-Ser  97.14 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544015  hitchhiker  0.0000175042 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0029  tRNA-Ser  97.14 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  58  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0031  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.137848  normal  0.0108409 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  100 
 
 		 109 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0012  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 114 bp  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0014  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>