10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1540 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1540  paREP9  100 
 
 		 124 aa  237  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.552044 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1944  paREP9  94.35 
 
 		 127 aa  227  5e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.899867  hitchhiker  0.000000000000153546 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0560  paREP9  95.87 
 
 		 121 aa  225  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.112364  hitchhiker  0.0000107885 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0043  paREP9  91.94 
 
 		 127 aa  223  8e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00594954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0001  paREP9  91.74 
 
 		 121 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1109  paREP9  92.56 
 
 		 121 aa  216  8.999999999999998e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.566716  hitchhiker  0.000160386 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0575  paREP9  91.74 
 
 		 121 aa  213  8e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.158938  normal  0.0596649 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0961  paREP9  90.91 
 
 		 121 aa  209  7.999999999999999e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.935966  hitchhiker  0.000271589 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0281  hypothetical protein  55.93 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1143  hypothetical protein  64.52 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0299368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>