18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4940 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4940  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0643  hypothetical protein  81.54 
 
 		 67 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4777  hypothetical protein  81.54 
 
 		 67 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.927704  hitchhiker  0.00369137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4653  hypothetical protein  81.54 
 
 		 67 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4831  hypothetical protein  81.54 
 
 		 67 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12560  hypothetical protein  71.01 
 
 		 69 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1143  hypothetical protein  71.01 
 
 		 69 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09950  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.698592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2500  hypothetical protein  52.31 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2604  hypothetical protein  52.73 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3743  hypothetical protein  52.24 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4240  hypothetical protein  49.02 
 
 		 69 aa  50.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3030  hypothetical protein  56.52 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.299577  normal  0.851885 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2673  hypothetical protein  45.45 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0293  hypothetical protein  45.28 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0231  hypothetical protein  48.78 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2565  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382416  normal  0.0961796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1577  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  42  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>