17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4777 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4653  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4777  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.927704  hitchhiker  0.00369137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4831  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0643  hypothetical protein  95.52 
 
 		 67 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4940  hypothetical protein  81.54 
 
 		 69 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12560  hypothetical protein  80.6 
 
 		 69 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1143  hypothetical protein  80.6 
 
 		 69 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09950  hypothetical protein  71.21 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.698592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2500  hypothetical protein  58.46 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2604  hypothetical protein  61.36 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3743  hypothetical protein  52.31 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0231  hypothetical protein  51.16 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4240  hypothetical protein  47.06 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2673  hypothetical protein  45.45 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0293  hypothetical protein  41.51 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3030  hypothetical protein  56.52 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.299577  normal  0.851885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2565  hypothetical protein  48.89 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382416  normal  0.0961796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>