20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4240 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4240  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  134  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1054  hypothetical protein  70.59 
 
 		 70 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0008  hypothetical protein  68.12 
 
 		 70 aa  93.2  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.301477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2604  hypothetical protein  66.67 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2565  hypothetical protein  63.24 
 
 		 70 aa  87  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382416  normal  0.0961796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1577  hypothetical protein  66.18 
 
 		 70 aa  84.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3030  hypothetical protein  63.49 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.299577  normal  0.851885 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0231  hypothetical protein  46.67 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2673  hypothetical protein  46.27 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4940  hypothetical protein  49.02 
 
 		 69 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12560  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1143  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09950  hypothetical protein  45.76 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.698592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0643  hypothetical protein  49.02 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2500  hypothetical protein  40.68 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4831  hypothetical protein  47.06 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4653  hypothetical protein  47.06 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4777  hypothetical protein  47.06 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.927704  hitchhiker  0.00369137 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0293  hypothetical protein  38.1 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3743  hypothetical protein  43.55 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.87408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>