21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2565 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2565  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382416  normal  0.0961796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1577  hypothetical protein  80 
 
 		 70 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1054  hypothetical protein  66.67 
 
 		 70 aa  89.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4240  hypothetical protein  63.24 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0008  hypothetical protein  66.15 
 
 		 70 aa  84.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.301477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3030  hypothetical protein  64.06 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.299577  normal  0.851885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2604  hypothetical protein  54.41 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2673  hypothetical protein  51.56 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0231  hypothetical protein  41.67 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09950  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.698592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1143  hypothetical protein  46.43 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12560  hypothetical protein  46.43 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0293  hypothetical protein  39.06 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4940  hypothetical protein  43.4 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4653  hypothetical protein  48.89 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2500  hypothetical protein  45.61 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4831  hypothetical protein  48.89 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4777  hypothetical protein  48.89 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.927704  hitchhiker  0.00369137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0643  hypothetical protein  45.1 
 
 		 67 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2240  hypothetical protein  52.94 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1947  hypothetical protein  52.94 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>