18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2500 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2500  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0643  hypothetical protein  58.46 
 
 
67 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4653  hypothetical protein  58.46 
 
 
67 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4777  hypothetical protein  58.46 
 
 
67 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.927704  hitchhiker  0.00369137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4831  hypothetical protein  58.46 
 
 
67 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4940  hypothetical protein  52.31 
 
 
69 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09950  hypothetical protein  47.69 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.698592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12560  hypothetical protein  50.77 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1143  hypothetical protein  50.77 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0231  hypothetical protein  53.12 
 
 
68 aa  62  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2673  hypothetical protein  45.9 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0293  hypothetical protein  45.76 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4240  hypothetical protein  40.68 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2604  hypothetical protein  44.9 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3743  hypothetical protein  40 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2565  hypothetical protein  45.61 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382416  normal  0.0961796 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1947  hypothetical protein  55.88 
 
 
72 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2240  hypothetical protein  52.94 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.261162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>