28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2383 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1880  putative virulence factor  65.31 
 
 		 832 aa  1088    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1952  putative virulence factor  54.88 
 
 		 679 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2383  Virulence effector, SrfC  100 
 
 		 815 aa  1665    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.971346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2284  hypothetical protein  55.86 
 
 		 674 aa  733    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.869648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1842  hypothetical protein  54.08 
 
 		 846 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2095  putative virulence factor  93.54 
 
 		 820 aa  1567    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2100  putative virulence factor  62.15 
 
 		 844 aa  1046    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1433  putative virulence factor  39.53 
 
 		 743 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0469  Virulence effector, SrfC  47.1 
 
 		 888 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4238  hypothetical protein  45.98 
 
 		 881 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52070  hypothetical protein  45.43 
 
 		 910 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1713  putative virulence effector protein  29.96 
 
 		 714 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1844  hypothetical protein  38.63 
 
 		 893 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1710  putative virulence effector protein  29.2 
 
 		 714 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1775  putative virulence effector protein  29.33 
 
 		 714 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.837936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1565  putative virulence effector protein  29.2 
 
 		 714 aa  303  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1746  putative virulence effector protein  29.08 
 
 		 714 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2110  putative virulence protein  28.16 
 
 		 726 aa  292  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.867276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2631  hypothetical protein  36.08 
 
 		 899 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.631713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2872  HopL1 protein  35.65 
 
 		 899 aa  281  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3153  virulence factor protein  30.18 
 
 		 901 aa  191  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490604  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0898  hypothetical protein  30.35 
 
 		 892 aa  188  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1963  virulence factor SrfC-like protein  32.24 
 
 		 862 aa  187  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4053  hypothetical protein  29.64 
 
 		 890 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0957492  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1314  virulence factor SrfC-like protein  29.36 
 
 		 878 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2282  virulence factor  50.57 
 
 		 185 aa  160  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3217  virulence factor SrfC-like protein  26.64 
 
 		 835 aa  107  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6480  hypothetical protein  28.37 
 
 		 938 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>