28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1842 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1880  putative virulence factor  52.36 
 
 		 832 aa  884    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2383  Virulence effector, SrfC  54.08 
 
 		 815 aa  884    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.971346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2100  putative virulence factor  51.32 
 
 		 844 aa  868    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1842  hypothetical protein  100 
 
 		 846 aa  1731    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2095  putative virulence factor  54.3 
 
 		 820 aa  894    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180077  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2284  hypothetical protein  98.65 
 
 		 674 aa  1349    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.869648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1952  putative virulence factor  99.26 
 
 		 679 aa  1375    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1433  putative virulence factor  37.59 
 
 		 743 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4238  hypothetical protein  45.32 
 
 		 881 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0469  Virulence effector, SrfC  44.16 
 
 		 888 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2282  virulence factor  97.21 
 
 		 185 aa  363  6e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2631  hypothetical protein  30.14 
 
 		 899 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.631713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2872  HopL1 protein  30.03 
 
 		 899 aa  330  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1844  hypothetical protein  30.04 
 
 		 893 aa  328  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52070  hypothetical protein  38.81 
 
 		 910 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2110  putative virulence protein  29.87 
 
 		 726 aa  318  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.867276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1565  putative virulence effector protein  28.82 
 
 		 714 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1746  putative virulence effector protein  28.82 
 
 		 714 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1713  putative virulence effector protein  28.82 
 
 		 714 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1775  putative virulence effector protein  28.82 
 
 		 714 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.837936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1710  putative virulence effector protein  28.69 
 
 		 714 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3153  virulence factor protein  30.39 
 
 		 901 aa  181  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490604  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0898  hypothetical protein  29.46 
 
 		 892 aa  171  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1963  virulence factor SrfC-like protein  30.52 
 
 		 862 aa  170  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4053  hypothetical protein  29.3 
 
 		 890 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0957492  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1314  virulence factor SrfC-like protein  29.22 
 
 		 878 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3217  virulence factor SrfC-like protein  26.7 
 
 		 835 aa  99  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6480  hypothetical protein  24.3 
 
 		 938 aa  88.6  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>