31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3273 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3273  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  662    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3919  hypothetical protein  43.35 
 
 		 334 aa  268  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2513  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  34.74 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3917  hypothetical protein  35.47 
 
 		 704 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197264  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0812  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  30.06 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16931  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3278  hypothetical protein  31.6 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1912  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  29.88 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2537  putative 4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  31.56 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1235  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  30.06 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4626  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  30.27 
 
 		 329 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1239  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  31.08 
 
 		 331 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4781  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  30.45 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2927  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  30.65 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1236  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  27.63 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4963  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  29.29 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344185  normal  0.0433285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2046  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase (OhpC)  27.88 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559961  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2784  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  29.29 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0992918  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4810  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  29.29 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2225  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  27.96 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3999  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  29.45 
 
 		 303 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4214  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  28.83 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3918  hypothetical protein  28.96 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3157  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  28.27 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487301  normal  0.0634262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2662  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  24.71 
 
 		 330 aa  92.8  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2840  hypothetical protein  28.04 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3748  hypothetical protein  25.68 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0043  hypothetical protein  24.31 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5224  hypothetical protein  23.1 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.175416 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5409  hypothetical protein  24.09 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0386  hypothetical protein  24.7 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0105  NMT1/THI5 like domain protein  28.49 
 
 		 314 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>