30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0043 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0043  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0386  hypothetical protein  48.43 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5224  hypothetical protein  48.24 
 
 		 326 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.175416 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5409  hypothetical protein  50 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2840  hypothetical protein  46.88 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4810  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  27.33 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2784  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  27.02 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0992918  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4963  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  27.02 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344185  normal  0.0433285 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0812  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  25.15 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16931  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4781  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  26.69 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2537  putative 4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  30.63 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2046  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase (OhpC)  28.36 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559961  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2513  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  27.76 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3157  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  29.55 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487301  normal  0.0634262 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4626  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  28.22 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1912  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  25.96 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2225  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  28.88 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1236  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  28.7 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1239  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  28.36 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4214  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  26.45 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2927  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  26.91 
 
 		 329 aa  90.1  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1235  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  25.52 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2662  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  26.07 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3748  hypothetical protein  27.36 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3999  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  24.73 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3273  hypothetical protein  24.31 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3917  hypothetical protein  23.6 
 
 		 704 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197264  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3919  hypothetical protein  26.79 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3278  hypothetical protein  23.33 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148142 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  29.17 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>