41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2771 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2771  5'-nucleotidase  100 
 
 
258 aa  528  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3358  5'-nucleotidase  62 
 
 
257 aa  305  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0297  5'-nucleotidase  37.67 
 
 
296 aa  141  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0290  5'-nucleotidase  37.67 
 
 
296 aa  141  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6934  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  35.08 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1746  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  35.48 
 
 
272 aa  138  7.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4339  5'-nucleotidase  34.15 
 
 
275 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1481  5'-nucleotidase  33.92 
 
 
275 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.376876 
 
 
-
 
NC_002950  PG0924  5'-nucleotidase  34.08 
 
 
271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4638  acid phosphatase  32.94 
 
 
275 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4258  acid phosphatase  32.14 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.641517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4639  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  32.94 
 
 
275 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.920677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0616  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  32.14 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4246  acid phosphatase  32.14 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4619  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  32.54 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4746  acid phosphatase  36.14 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4406  acid phosphatase  36.14 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4623  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  31.75 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1767  acid phosphatase  33.49 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000413587  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1501  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  33.91 
 
 
269 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1456  5'-nucleotidase  32.51 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2497  5'-nucleotidase  34.69 
 
 
268 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1079  acid phosphatase (Class B)  34.78 
 
 
275 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000160418  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0190  5'-nucleotidase  32.35 
 
 
287 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0188  5'-nucleotidase  31.37 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03615  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  32.74 
 
 
336 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28250  putative secreted acid phosphatase  30.5 
 
 
379 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1332  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  30.29 
 
 
269 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1069  acid phosphatase class B  30.7 
 
 
272 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000258294  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1239  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  31.28 
 
 
264 aa  99  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.619067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2020  secreted acid phosphatase-like protein  35.96 
 
 
238 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3380  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  27.35 
 
 
271 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000119479  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2236  acid phosphatase (Class B)  32.02 
 
 
272 aa  95.5  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0053  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  31.88 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127569  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0294  acid phosphatase class B  27.37 
 
 
315 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0918  acid phosphatase (Class B)  29.82 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1231  acid phosphatase (Class B)  32.22 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000100818  normal  0.0153766 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03813  acid phosphatase  24.26 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4705  acid phosphatase class B  26.32 
 
 
294 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.987217  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0442  putative acid phosphatase  27.97 
 
 
224 aa  46.2  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00002252  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1744  acid phosphatase  27.97 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.854752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>