40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4705 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4705  acid phosphatase class B  100 
 
 
294 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.987217  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1239  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  32.1 
 
 
264 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.619067  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1069  acid phosphatase class B  27.27 
 
 
272 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000258294  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1079  acid phosphatase (Class B)  30.29 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000160418  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0918  acid phosphatase (Class B)  29.08 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2236  acid phosphatase (Class B)  31.62 
 
 
272 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0924  5'-nucleotidase  32.06 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3380  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  28.51 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000119479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1456  5'-nucleotidase  28.87 
 
 
276 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6934  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  27.31 
 
 
272 aa  85.5  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03615  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  38.73 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4639  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  29.69 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.920677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4246  acid phosphatase  29.69 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1501  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  26.94 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1767  acid phosphatase  27.01 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000413587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4619  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  29.17 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4638  acid phosphatase  29.17 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4339  5'-nucleotidase  28.33 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4623  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  29.17 
 
 
275 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4258  acid phosphatase  29.17 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.641517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4406  acid phosphatase  28.89 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4746  acid phosphatase  28.89 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0616  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  28.12 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0053  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  35.26 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127569  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1481  5'-nucleotidase  28.26 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.376876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2497  5'-nucleotidase  29.96 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1746  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  26.76 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1332  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  28.06 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0297  5'-nucleotidase  23.65 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0290  5'-nucleotidase  23.65 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0188  5'-nucleotidase  26.01 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28250  putative secreted acid phosphatase  28.95 
 
 
379 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3358  5'-nucleotidase  27.51 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0190  5'-nucleotidase  26.59 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0294  acid phosphatase class B  23.48 
 
 
315 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1231  acid phosphatase (Class B)  26.9 
 
 
257 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000100818  normal  0.0153766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2771  5'-nucleotidase  26.32 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2020  secreted acid phosphatase-like protein  26.38 
 
 
238 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf533  lipoprotein, putative acid phosphatase  21.69 
 
 
369 aa  47.8  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0684914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0567  hypothetical protein  25.81 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>