43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2236 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2236  acid phosphatase (Class B)  100 
 
 
272 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1069  acid phosphatase class B  76.84 
 
 
272 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000258294  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0918  acid phosphatase (Class B)  73.9 
 
 
272 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1079  acid phosphatase (Class B)  73.16 
 
 
275 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000160418  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1231  acid phosphatase (Class B)  70.67 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000100818  normal  0.0153766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03615  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  40 
 
 
336 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0053  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  40.57 
 
 
307 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127569  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1239  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  35.88 
 
 
264 aa  155  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.619067  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0294  acid phosphatase class B  37.35 
 
 
315 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4339  5'-nucleotidase  33.33 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1767  acid phosphatase  34.62 
 
 
289 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000413587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6934  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  34.78 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4638  acid phosphatase  32.5 
 
 
275 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4623  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  32.5 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4639  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  32.5 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.920677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4406  acid phosphatase  32.08 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0290  5'-nucleotidase  32.49 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0297  5'-nucleotidase  32.49 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4746  acid phosphatase  32.08 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4246  acid phosphatase  32.08 
 
 
275 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0616  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  32.76 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4619  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  32.76 
 
 
275 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2497  5'-nucleotidase  31.84 
 
 
268 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1481  5'-nucleotidase  35.53 
 
 
275 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.376876 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4258  acid phosphatase  32.38 
 
 
275 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.641517  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0190  5'-nucleotidase  33.48 
 
 
287 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3380  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  31.73 
 
 
271 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000119479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1456  5'-nucleotidase  32.95 
 
 
276 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0188  5'-nucleotidase  32.62 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1746  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  33.33 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0924  5'-nucleotidase  34.22 
 
 
271 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1501  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  32.34 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3358  5'-nucleotidase  31.17 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1332  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  30.48 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2771  5'-nucleotidase  32.02 
 
 
258 aa  95.5  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2020  secreted acid phosphatase-like protein  30.9 
 
 
238 aa  93.2  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4705  acid phosphatase class B  30.83 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.987217  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28250  putative secreted acid phosphatase  26.18 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03813  acid phosphatase  27.34 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0615  5'-nucleotidase, lipoprotein e  27.97 
 
 
506 aa  68.2  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00211957  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf533  lipoprotein, putative acid phosphatase  37.68 
 
 
369 aa  52.8  0.000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0684914  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0102  acid phosphatase class B  27.71 
 
 
224 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3004  acid phosphatase (Class B)  26.98 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>