57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2500 on replicon NC_007968
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007968  Pcryo_2500  transposase  100 
 
 
87 aa  179  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  36.78 
 
 
250 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  36.78 
 
 
250 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  38.1 
 
 
252 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  35.9 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  35.9 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  38.37 
 
 
245 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  37.35 
 
 
252 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  37.35 
 
 
252 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2056  hypothetical protein  38.16 
 
 
124 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  37.35 
 
 
252 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  37.35 
 
 
252 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  37.35 
 
 
252 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  37.35 
 
 
252 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  37.35 
 
 
252 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  37.35 
 
 
252 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  43.24 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  43.24 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  43.24 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  43.24 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  43.24 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  35.9 
 
 
254 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  35.9 
 
 
254 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  35.9 
 
 
254 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  35.9 
 
 
254 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  35.9 
 
 
254 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  35.9 
 
 
254 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 
142 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 
142 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  35.63 
 
 
249 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  34.62 
 
 
254 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  34.62 
 
 
254 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  34.62 
 
 
254 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  34.62 
 
 
254 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  34.62 
 
 
254 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 
252 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  35.44 
 
 
235 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.89 
 
 
281 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.89 
 
 
281 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  34.15 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  32.89 
 
 
260 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  32.89 
 
 
260 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  32.89 
 
 
260 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  32.89 
 
 
260 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.74 
 
 
281 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.94 
 
 
281 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  35.09 
 
 
210 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  35.09 
 
 
210 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  35.09 
 
 
210 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  31.25 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  32.91 
 
 
255 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  31.43 
 
 
176 aa  40.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  31.43 
 
 
176 aa  40.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  31.43 
 
 
176 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  31.43 
 
 
176 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4249  transposase, IS4 family protein  31.65 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609273  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  30.77 
 
 
260 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>