18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2010 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2010  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  628  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0146839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1668  hypothetical protein  54.33 
 
 
306 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2926  hypothetical protein  55.05 
 
 
302 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2545  hypothetical protein  53.16 
 
 
306 aa  346  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000168949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1125  hypothetical protein  52.92 
 
 
301 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2672  hypothetical protein  54.01 
 
 
302 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.903124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0083  hypothetical protein  52.61 
 
 
300 aa  291  8e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3340  hypothetical protein  47.39 
 
 
312 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.192255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1499  hypothetical protein  35.37 
 
 
315 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0947552  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1493  hypothetical protein  33.57 
 
 
314 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1588  hypothetical protein  33.57 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0392601  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2371  hypothetical protein  33.21 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0221903  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0434  hypothetical protein  36.73 
 
 
292 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0783  hypothetical protein  36.36 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2509  hypothetical protein  35.97 
 
 
296 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1527  hypothetical protein  33.6 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0591  hypothetical protein  29.67 
 
 
330 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0787  hypothetical protein  32.43 
 
 
277 aa  56.2  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000349746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>