18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3340 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3340  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  644    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.192255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1668  hypothetical protein  53.22 
 
 
306 aa  345  7e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2926  hypothetical protein  54.45 
 
 
302 aa  340  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2545  hypothetical protein  52.54 
 
 
306 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000168949 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0083  hypothetical protein  57.75 
 
 
300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1125  hypothetical protein  50.85 
 
 
301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2672  hypothetical protein  51.93 
 
 
302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.903124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2010  hypothetical protein  47.16 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0146839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1499  hypothetical protein  35.69 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0947552  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1493  hypothetical protein  33.93 
 
 
314 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2371  hypothetical protein  33.93 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0221903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1588  hypothetical protein  33.57 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0392601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0783  hypothetical protein  32.81 
 
 
290 aa  142  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0434  hypothetical protein  33.71 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0591  hypothetical protein  33.22 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1527  hypothetical protein  30.04 
 
 
284 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2509  hypothetical protein  29.41 
 
 
296 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0787  hypothetical protein  28.08 
 
 
277 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000349746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>