18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2545 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2545  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000168949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1668  hypothetical protein  98.04 
 
 
306 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2926  hypothetical protein  75 
 
 
302 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1125  hypothetical protein  71.33 
 
 
301 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2672  hypothetical protein  72.82 
 
 
302 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.903124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0083  hypothetical protein  62.37 
 
 
300 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3340  hypothetical protein  52.96 
 
 
312 aa  333  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.192255  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2010  hypothetical protein  53.16 
 
 
306 aa  322  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0146839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1499  hypothetical protein  34.72 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0947552  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1493  hypothetical protein  36.14 
 
 
314 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2371  hypothetical protein  36.14 
 
 
314 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0221903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1588  hypothetical protein  36.14 
 
 
314 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0392601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0783  hypothetical protein  34.85 
 
 
290 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0434  hypothetical protein  34.4 
 
 
292 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1527  hypothetical protein  33.08 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0591  hypothetical protein  32.65 
 
 
330 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2509  hypothetical protein  32.05 
 
 
296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0787  hypothetical protein  30.28 
 
 
277 aa  56.6  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000349746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>