18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1125 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1125  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  626  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2672  hypothetical protein  80.97 
 
 
302 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.903124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2926  hypothetical protein  75.78 
 
 
302 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2545  hypothetical protein  71.33 
 
 
306 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000168949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1668  hypothetical protein  71.33 
 
 
306 aa  454  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0083  hypothetical protein  58.19 
 
 
300 aa  344  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3340  hypothetical protein  51.39 
 
 
312 aa  326  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.192255  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2010  hypothetical protein  52.92 
 
 
306 aa  318  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0146839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1499  hypothetical protein  37.01 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0947552  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1493  hypothetical protein  38.15 
 
 
314 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2371  hypothetical protein  38.15 
 
 
314 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0221903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1588  hypothetical protein  38.15 
 
 
314 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0392601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0783  hypothetical protein  33.2 
 
 
290 aa  152  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0434  hypothetical protein  32.4 
 
 
292 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1527  hypothetical protein  33.2 
 
 
284 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2509  hypothetical protein  31.64 
 
 
296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0591  hypothetical protein  32.44 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0787  hypothetical protein  29.36 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000349746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>