18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1668 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1668  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  633  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2545  hypothetical protein  98.04 
 
 
306 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000168949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2926  hypothetical protein  76.04 
 
 
302 aa  474  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1125  hypothetical protein  71.33 
 
 
301 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2672  hypothetical protein  73.17 
 
 
302 aa  421  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.903124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0083  hypothetical protein  63.07 
 
 
300 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3340  hypothetical protein  53.66 
 
 
312 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.192255  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2010  hypothetical protein  54.15 
 
 
306 aa  328  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0146839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1499  hypothetical protein  35.07 
 
 
315 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0947552  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1493  hypothetical protein  34.66 
 
 
314 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1588  hypothetical protein  34.66 
 
 
314 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0392601  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2371  hypothetical protein  34.66 
 
 
314 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0221903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0783  hypothetical protein  35.23 
 
 
290 aa  156  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0434  hypothetical protein  34.4 
 
 
292 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1527  hypothetical protein  34.56 
 
 
284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0591  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2509  hypothetical protein  32.05 
 
 
296 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0787  hypothetical protein  31.19 
 
 
277 aa  60.1  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000349746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>