12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1712 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1712  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 204 aa  393  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0116  uroporphyrinogen III synthase HEM4  71.57 
 
 		 215 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.478002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2250  uroporphyrinogen III synthase HEM4  64.58 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.105243  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1898  uroporphyrinogen III synthase HEM4  68.02 
 
 		 210 aa  234  8e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.108493 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1901  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.91 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.332563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0218  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.93 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000144428  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.54 
 
 		 504 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.72 
 
 		 497 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2562  uroporphyrinogen-III synthase  31.47 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0493  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.11 
 
 		 267 aa  43.9  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.12 
 
 		 504 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.82 
 
 		 491 aa  41.6  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>