23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0218 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0218  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000144428  normal  0.0267075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1164  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  39.66 
 
 
237 aa  145  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.605795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.34 
 
 
512 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1712  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.93 
 
 
204 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.57 
 
 
508 aa  58.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2250  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.26 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.105243  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.86 
 
 
511 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  26.63 
 
 
520 aa  56.6  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0116  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.89 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.478002  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.98 
 
 
492 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.53 
 
 
579 aa  53.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.6 
 
 
506 aa  51.6  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.09 
 
 
502 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.25 
 
 
504 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2069  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.89 
 
 
522 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.198087  hitchhiker  0.000347629 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1376  uroporphyrinogen III synthase HEM4  45.9 
 
 
258 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95913  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  29.19 
 
 
513 aa  48.5  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28 
 
 
507 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.37 
 
 
505 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0516  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.36 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.655378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.18 
 
 
504 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.72 
 
 
503 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.37 
 
 
503 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>