13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0116 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0116  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 
215 aa  423  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.478002  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1712  uroporphyrinogen III synthase HEM4  71.57 
 
 
204 aa  271  5.000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1898  uroporphyrinogen III synthase HEM4  69.38 
 
 
210 aa  262  3e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.108493 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2250  uroporphyrinogen III synthase HEM4  62.94 
 
 
210 aa  258  4e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.105243  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1901  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.51 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.332563  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0218  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.89 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000144428  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.54 
 
 
504 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.71 
 
 
497 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2012  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.88 
 
 
242 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3677  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.98 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1164  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.7 
 
 
237 aa  42  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.605795  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  26.42 
 
 
526 aa  42  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.5 
 
 
510 aa  41.6  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>