More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0448 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0448  aldo/keto reductase  100 
 
 
287 aa  594  1e-169  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0994  aldo/keto reductase  63.37 
 
 
275 aa  375  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.0253883 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0358  aldo/keto reductase  62.5 
 
 
274 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.421482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0944  aldo/keto reductase  48.15 
 
 
281 aa  250  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1557  aldo/keto reductase  50.56 
 
 
270 aa  246  4e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0593  aldo/keto reductase  45.04 
 
 
292 aa  236  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000835001  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1806  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
272 aa  234  9e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.155578 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1630  aldo/keto reductase  48.08 
 
 
270 aa  227  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0489  aldo/keto reductase  45.77 
 
 
277 aa  215  9e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0946  aldo/keto reductase  35.41 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.837346  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0452  aldo/keto reductase  37.55 
 
 
265 aa  173  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1578  aldo/keto reductase  38.49 
 
 
281 aa  172  7.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0586561  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  36.47 
 
 
280 aa  159  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  33.22 
 
 
318 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  33.97 
 
 
274 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  33.97 
 
 
274 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  31.76 
 
 
317 aa  142  9e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  33.46 
 
 
317 aa  135  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  30.43 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.97 
 
 
277 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  30.19 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2429  aldo/keto reductase  34.19 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43714  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  32.58 
 
 
281 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3314  aldo/keto reductase  34.39 
 
 
283 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1963  aldo/keto reductase  30.34 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.152585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  31.99 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2737  aldo/keto reductase  34.34 
 
 
273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1860  aldo/keto reductase  29.5 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000397966  hitchhiker  0.000000000147499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2530  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
282 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2596  aldo/keto reductase  34.47 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  31.06 
 
 
281 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2579  aldo/keto reductase  31.72 
 
 
281 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3927  aldo/keto reductase  32.46 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.124161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  35.02 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2256  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.84 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0755  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.32 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.181791  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1990  aldo/keto reductase  30.83 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0551  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.84 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2128  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.84 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  33.9 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0556  aldo/keto reductase  30.74 
 
 
277 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  30 
 
 
281 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1919  aldo/keto reductase  30.88 
 
 
281 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2531  aldo/keto reductase  30.88 
 
 
281 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0948  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.46 
 
 
286 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0952  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.84 
 
 
281 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1256  aldo/keto reductase  34.57 
 
 
273 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332065  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2555  aldo/keto reductase  30.88 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4115  aldo/keto reductase  31.62 
 
 
315 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.905016 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1101  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.46 
 
 
281 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.16541  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3054  aldo/keto reductase  35.74 
 
 
284 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00284405  normal  0.275576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  31.34 
 
 
281 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  31.91 
 
 
284 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5863  aldo/keto reductase  30.6 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1775  aldo/keto reductase  30.89 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360255  normal  0.42247 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2259  aldo/keto reductase  29.96 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2789  aldo/keto reductase  32.13 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158204  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3732  aldo/keto reductase  31.02 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3120  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.15 
 
 
253 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00828042  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  31.18 
 
 
282 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0716  aldo/keto reductase  32.62 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.93631  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1308  aldo/keto reductase  28.96 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4255  aldo/keto reductase  31.34 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.77 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.04 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.04 
 
 
282 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.04 
 
 
282 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.04 
 
 
282 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  31.27 
 
 
326 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.04 
 
 
282 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1685  aldo/keto reductase  29.08 
 
 
300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  30.04 
 
 
284 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  30.04 
 
 
284 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  30.04 
 
 
284 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  30.04 
 
 
284 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.04 
 
 
284 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  29.96 
 
 
281 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3502  aldo/keto reductase  34.7 
 
 
276 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0118394  normal  0.431594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.04 
 
 
284 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.67 
 
 
284 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  30.95 
 
 
277 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  30.46 
 
 
331 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  29.87 
 
 
327 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  30.85 
 
 
293 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4714  oxidoreductase  31.91 
 
 
273 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2369  aldo/keto reductase  30.08 
 
 
294 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  31.65 
 
 
293 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0706  aldo/keto reductase  27.7 
 
 
284 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000923637  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0026  hypothetical protein  31.4 
 
 
325 aa  105  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  30.72 
 
 
324 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1975  aldo/keto reductase  28.62 
 
 
284 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0644  aldo/keto reductase  29.79 
 
 
315 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282625  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2041  aldo/keto reductase  28.36 
 
 
272 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4579  aldo/keto reductase  31.74 
 
 
312 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0458  aldo/keto reductase  28.97 
 
 
314 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0654121  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.09 
 
 
329 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1670  aldo/keto reductase  31.42 
 
 
322 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  30.15 
 
 
331 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  30.48 
 
 
296 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2893  aldo/keto reductase  28.94 
 
 
289 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>