15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0367 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0367  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  359  1e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0973  hypothetical protein  78.29 
 
 
175 aa  251  3e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00177478  unclonable  0.000000000000129242 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0284  hypothetical protein  71.35 
 
 
180 aa  221  7e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0402669  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1830  hypothetical protein  54.7 
 
 
180 aa  169  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.483893  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0852  Protein of unknown function DUF998  42.94 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0305034  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0753  membrane protein-like protein  46.06 
 
 
180 aa  94.4  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0273927 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0116  Protein of unknown function DUF998  39.08 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.163433  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2455  Protein of unknown function DUF998  34.25 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0892  hypothetical protein  35.23 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.699253  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0688  Protein of unknown function DUF998  37.08 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0927  hypothetical protein  34.78 
 
 
252 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2312  hypothetical protein  34.88 
 
 
216 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.728668  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3103  hypothetical protein  32.3 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572416  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4440  hypothetical protein  30 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2819  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0457027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>