13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0973 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0973  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  330  5e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00177478  unclonable  0.000000000000129242 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0367  hypothetical protein  78.29 
 
 
191 aa  256  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0284  hypothetical protein  70.11 
 
 
180 aa  219  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0402669  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1830  hypothetical protein  52.87 
 
 
180 aa  157  9e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.483893  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0852  Protein of unknown function DUF998  44.17 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0305034  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0753  membrane protein-like protein  43.26 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0273927 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2455  Protein of unknown function DUF998  32.45 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0116  Protein of unknown function DUF998  34.12 
 
 
210 aa  72  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.163433  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0892  hypothetical protein  34.12 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.699253  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0688  Protein of unknown function DUF998  35.71 
 
 
211 aa  67  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0927  hypothetical protein  31.53 
 
 
252 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2312  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.728668  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3103  hypothetical protein  29.65 
 
 
216 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>