99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1126 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1126  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  321  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2878  hypothetical protein  82.35 
 
 		 159 aa  271  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.051006  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2950  hypothetical protein  80.39 
 
 		 158 aa  267  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2714  hypothetical protein  79.87 
 
 		 158 aa  266  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3096  hypothetical protein  78.57 
 
 		 158 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3095  hypothetical protein  79.74 
 
 		 158 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5951  hypothetical protein  79.25 
 
 		 159 aa  264  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0717221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5947  hypothetical protein  79.22 
 
 		 180 aa  263  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.392478  normal  0.247967 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5707  hypothetical protein  79.25 
 
 		 159 aa  263  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.241094 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5703  hypothetical protein  79.22 
 
 		 159 aa  262  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.176651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1552  protein of unknown function DUF1348  79.74 
 
 		 158 aa  261  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2722  hypothetical protein  79.08 
 
 		 158 aa  261  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3482  hypothetical protein  80.92 
 
 		 157 aa  259  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0639508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2002  protein of unknown function DUF1348  77.22 
 
 		 158 aa  259  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5658  hypothetical protein  76.77 
 
 		 155 aa  258  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0315796  normal  0.016815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4515  hypothetical protein  77.78 
 
 		 159 aa  257  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0502513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1931  hypothetical protein  80.26 
 
 		 157 aa  257  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4893  hypothetical protein  73.86 
 
 		 159 aa  248  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0457515 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4646  protein of unknown function DUF1348  74.51 
 
 		 158 aa  248  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350473  normal  0.0402435 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4514  protein of unknown function DUF1348  74.51 
 
 		 158 aa  248  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0912  protein of unknown function DUF1348  75.84 
 
 		 153 aa  247  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4684  hypothetical protein  74.51 
 
 		 154 aa  246  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.787791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1059  protein of unknown function DUF1348  73.83 
 
 		 153 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3327  hypothetical protein  72.55 
 
 		 154 aa  245  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2439  protein of unknown function DUF1348  73.86 
 
 		 157 aa  245  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7843  hypothetical protein  75 
 
 		 153 aa  244  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7000  protein of unknown function DUF1348  69.68 
 
 		 159 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2653  hypothetical protein  70.97 
 
 		 155 aa  242  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0650583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0675  hypothetical protein  75.68 
 
 		 153 aa  242  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286639  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3017  hypothetical protein  69.68 
 
 		 159 aa  240  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0012  hypothetical protein  69.28 
 
 		 202 aa  240  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3103  hypothetical protein  71.24 
 
 		 154 aa  239  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.45009  normal  0.493959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3423  protein of unknown function DUF1348  71.24 
 
 		 154 aa  239  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1157  hypothetical protein  69.28 
 
 		 159 aa  240  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0009  hypothetical protein  69.28 
 
 		 159 aa  240  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1437  hypothetical protein  69.28 
 
 		 159 aa  240  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558823  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0012  hypothetical protein  69.28 
 
 		 159 aa  240  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2217  hypothetical protein  71.43 
 
 		 158 aa  238  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6181  hypothetical protein  72.55 
 
 		 156 aa  238  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1973  hypothetical protein  73.68 
 
 		 154 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0011  hypothetical protein  69.28 
 
 		 159 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2764  hypothetical protein  70.59 
 
 		 154 aa  236  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1516  hypothetical protein  68.63 
 
 		 202 aa  236  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0012  hypothetical protein  68.63 
 
 		 159 aa  236  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71230  hypothetical protein  71.9 
 
 		 156 aa  236  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1878  hypothetical protein  73.2 
 
 		 154 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2246  hypothetical protein  71.43 
 
 		 157 aa  236  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.123131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2135  protein of unknown function DUF1348  72.37 
 
 		 157 aa  234  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3174  hypothetical protein  68.63 
 
 		 159 aa  234  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3261  hypothetical protein  69.03 
 
 		 155 aa  234  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00195182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4975  hypothetical protein  68.63 
 
 		 159 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673999  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1606  protein of unknown function DUF1348  68.39 
 
 		 155 aa  233  6e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3118  hypothetical protein  67.97 
 
 		 159 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.49314 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4163  hypothetical protein  69.68 
 
 		 158 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5705  hypothetical protein  67.97 
 
 		 159 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0343113 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4533  hypothetical protein  67.97 
 
 		 159 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.870007 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5154  hypothetical protein  67.97 
 
 		 159 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5318  hypothetical protein  67.1 
 
 		 159 aa  231  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1116  protein of unknown function DUF1348  68.63 
 
 		 154 aa  229  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1007  hypothetical protein  67.74 
 
 		 155 aa  229  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1105  protein of unknown function DUF1348  68.63 
 
 		 157 aa  229  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1522  hypothetical protein  67.1 
 
 		 156 aa  223  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5338  protein of unknown function DUF1348  64.05 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.563767  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2837  hypothetical protein  66.67 
 
 		 153 aa  221  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.811384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5027  hypothetical protein  64.71 
 
 		 156 aa  220  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2759  hypothetical protein  66.67 
 
 		 153 aa  221  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000552736  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1555  protein of unknown function DUF1348  67.32 
 
 		 154 aa  219  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94764  hitchhiker  0.00210584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1039  hypothetical protein  64.56 
 
 		 158 aa  218  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1147  hypothetical protein  65.16 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.951304  normal  0.857811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2823  response regulator receiver domain-containing protein  62.75 
 
 		 164 aa  217  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1475  hypothetical protein  63.87 
 
 		 155 aa  216  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3296  protein of unknown function DUF1348  74.81 
 
 		 135 aa  216  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321497  normal  0.440493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3483  hypothetical protein  67.32 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0042  protein of unknown function DUF1348  63.4 
 
 		 155 aa  211  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2673  hypothetical protein  62.09 
 
 		 162 aa  211  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14634  normal  0.0596493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2389  hypothetical protein  66.45 
 
 		 153 aa  211  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31878  predicted protein  60.51 
 
 		 157 aa  210  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0598588  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3842  hypothetical protein  65.1 
 
 		 153 aa  209  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7146  protein of unknown function DUF1348  70.59 
 
 		 136 aa  205  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1113  hypothetical protein  61.94 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2347  hypothetical protein  60.51 
 
 		 158 aa  204  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.144596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5610  hypothetical protein  61.84 
 
 		 155 aa  204  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3432  hypothetical protein  62.09 
 
 		 154 aa  203  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5318  hypothetical protein  61.84 
 
 		 155 aa  203  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5230  hypothetical protein  61.84 
 
 		 155 aa  203  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.296871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1334  protein of unknown function DUF1348  65.94 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2665  protein of unknown function DUF1348  60.78 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1907  protein of unknown function DUF1348  65.94 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4265  hypothetical protein  60 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1296  protein of unknown function DUF1348  59.33 
 
 		 155 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.555087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6224  protein of unknown function DUF1348  63.5 
 
 		 149 aa  192  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.524129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2261  hypothetical protein  63.04 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  0.0392476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0802  protein of unknown function DUF1348  63.43 
 
 		 136 aa  187  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2964  hypothetical protein  63.97 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0876  protein of unknown function DUF1348  60.94 
 
 		 155 aa  168  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28330  hypothetical protein  55.71 
 
 		 152 aa  168  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0182368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4732  hypothetical protein  54.86 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.962547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1221  hypothetical protein  56.69 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0134027 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01120  conserved hypothetical protein  42.96 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>