15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2790 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2790  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  726    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  98.25 
 
 
3563 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2788  hypothetical protein  73.09 
 
 
381 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  96.19 
 
 
5212 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  96.19 
 
 
980 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32810  hypothetical protein  96.34 
 
 
103 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394592  decreased coverage  0.0000000271054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32820  hypothetical protein  78.95 
 
 
195 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000257187  hitchhiker  0.00000834291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.05 
 
 
3862 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02473  putative hemagglutinin-related protein  33.33 
 
 
848 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335971  normal  0.337547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  38.24 
 
 
2904 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2782  hemagglutinin  38.24 
 
 
576 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2219  putative hemagglutinin-related protein  25.54 
 
 
455 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0473724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  35.8 
 
 
3443 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  41.94 
 
 
991 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.4 
 
 
3884 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>