18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2788 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2788  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  778    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  96.15 
 
 
5212 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  92.74 
 
 
3563 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  96.15 
 
 
980 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2790  hypothetical protein  73.09 
 
 
355 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  61.38 
 
 
2588 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1925  hypothetical protein  53.21 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0235934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32810  hypothetical protein  94.25 
 
 
103 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394592  decreased coverage  0.0000000271054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32820  hypothetical protein  98.63 
 
 
195 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000257187  hitchhiker  0.00000834291 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2206  hypothetical protein  37.11 
 
 
196 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2050  hypothetical protein  37.11 
 
 
196 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.24 
 
 
3862 aa  89.7  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02473  putative hemagglutinin-related protein  32.68 
 
 
848 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335971  normal  0.337547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  37.31 
 
 
2904 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4356  hypothetical protein  31.48 
 
 
117 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000012035  hitchhiker  1.28724e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2782  hemagglutinin  37.31 
 
 
576 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  35.8 
 
 
3443 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  40 
 
 
991 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>