13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4978 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4978  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  746    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4851  hypothetical protein  96.09 
 
 		 358 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0599931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5027  hypothetical protein  91.06 
 
 		 358 aa  678    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0487  hypothetical protein  81.79 
 
 		 358 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0529  hypothetical protein  55.75 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05580  hypothetical protein  55.17 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1627  hypothetical protein  33.02 
 
 		 363 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.197704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4090  hypothetical protein  33.23 
 
 		 355 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1229  hypothetical protein  33.01 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000235297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1691  hypothetical protein  29.71 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0956962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0560  hypothetical protein  32.63 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.294179  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0606  hypothetical protein  22.79 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4163  hypothetical protein  26.55 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.553916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>