15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0560 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0560  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.294179  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1229  hypothetical protein  37.33 
 
 		 352 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000235297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0487  hypothetical protein  31.73 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4090  hypothetical protein  35.59 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1691  hypothetical protein  34.08 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0956962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0529  hypothetical protein  33.05 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0606  hypothetical protein  27.71 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4978  hypothetical protein  32.63 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5027  hypothetical protein  31.36 
 
 		 358 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05580  hypothetical protein  33.05 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1627  hypothetical protein  34.22 
 
 		 363 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.197704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4851  hypothetical protein  31.67 
 
 		 358 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0599931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1972  hypothetical protein  26.42 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201886 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4163  hypothetical protein  27.37 
 
 		 331 aa  52.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2280  hypothetical protein  23.45 
 
 		 346 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.516476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>