14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5027 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4978  hypothetical protein  91.06 
 
 		 361 aa  678    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4851  hypothetical protein  91.06 
 
 		 358 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0599931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5027  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  738    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0487  hypothetical protein  80.95 
 
 		 358 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0529  hypothetical protein  56 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05580  hypothetical protein  55.71 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1627  hypothetical protein  32.81 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.197704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4090  hypothetical protein  32.18 
 
 		 355 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1229  hypothetical protein  31.76 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000235297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1691  hypothetical protein  31.23 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0956962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0560  hypothetical protein  31.36 
 
 		 289 aa  99.8  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.294179  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0606  hypothetical protein  22.1 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4163  hypothetical protein  26.55 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.553916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1972  hypothetical protein  21.99 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>