52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1686 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1686  Heme oxygenase  100 
 
 
236 aa  483  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.454788  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18031  Heme oxygenase  93.64 
 
 
236 aa  453  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17861  Heme oxygenase  94.07 
 
 
236 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17811  Heme oxygenase  88.56 
 
 
236 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0166  Heme oxygenase (decyclizing)  63.98 
 
 
237 aa  336  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0196  Heme oxygenase (decyclizing)  65.68 
 
 
243 aa  335  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.895775  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20441  Heme oxygenase  66.38 
 
 
235 aa  334  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.810996 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1169  Heme oxygenase  65.96 
 
 
235 aa  332  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17151  Heme oxygenase  65.11 
 
 
235 aa  331  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.714978  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22411  Heme oxygenase  62.98 
 
 
239 aa  324  7e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2962  Heme oxygenase  60 
 
 
239 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243829  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1414  Heme oxygenase  59.57 
 
 
238 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1380  Heme oxygenase  59.57 
 
 
238 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1858  Heme oxygenase (decyclizing)  59.57 
 
 
238 aa  296  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206398  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3635  Heme oxygenase  59.75 
 
 
240 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0335  Heme oxygenase (decyclizing)  60 
 
 
239 aa  295  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0979075  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3767  Heme oxygenase  57.02 
 
 
238 aa  292  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00293088  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2851  heme oxygenase  57.87 
 
 
238 aa  287  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3827  Heme oxygenase  49.15 
 
 
237 aa  254  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0101  Heme oxygenase  51.68 
 
 
256 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0098  Heme oxygenase  51.68 
 
 
256 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.627475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4780  Heme oxygenase  46.41 
 
 
251 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2604  Heme oxygenase  50.42 
 
 
248 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3387  heme oxygenase  40.36 
 
 
224 aa  188  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562296  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_5902  predicted protein  41.23 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1431  Heme oxygenase  38.81 
 
 
230 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385185  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2345  heme oxygenase (decyclizing)  34.95 
 
 
230 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12588  predicted protein  38.39 
 
 
207 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0441  Heme oxygenase  33.17 
 
 
235 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379779  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0079  Heme oxygenase  30.58 
 
 
223 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3241  Heme oxygenase  34.33 
 
 
217 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00174182  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1054  Heme oxygenase  33.96 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.623466  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2758  Heme oxygenase  34.63 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126607  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1727  Heme oxygenase  31.34 
 
 
220 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3872  Heme oxygenase  32.04 
 
 
225 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  normal  0.243926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3062  Heme oxygenase  31.6 
 
 
217 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4613  Heme oxygenase  31.48 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35580  heme oxygenase  33.33 
 
 
216 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3984  Heme oxygenase (decyclizing)  33.68 
 
 
227 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85445  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3085  Heme oxygenase  34.13 
 
 
214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0990  Heme oxygenase  32.68 
 
 
215 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6429  heme oxygenase  35.03 
 
 
202 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0203  heme oxygenase 2  30.58 
 
 
214 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.417948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0205  heme oxygenase  30.58 
 
 
214 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1310  Heme oxygenase (decyclizing)  29.53 
 
 
226 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.608398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3739  Heme oxygenase (decyclizing)  31.61 
 
 
227 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0567134  hitchhiker  0.000363645 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08750  heme oxygenase  29.52 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01200  heme oxygenase 2, putative  24.91 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25691  heme oxygenase  65.91 
 
 
77 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86063  heme binding protein  25.62 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.507414  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_55416  predicted protein  26.83 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89558  predicted protein  27.1 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.27472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>