57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50354 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_50354  Riboflavin kinase (Flavin mononucleotide kinase 1)  100 
 
 
178 aa  371  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.290032 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05850  riboflavin kinase, putative  41.26 
 
 
242 aa  154  7e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07469  Riboflavin kinase (EC 2.7.1.26)(Flavin mononucleotide kinase 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW61]  40.3 
 
 
210 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.285247  normal  0.866667 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29210  predicted protein  35.71 
 
 
289 aa  107  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.051263  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12172  predicted protein  29.63 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9092  predicted protein  29.8 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1516  riboflavin biosynthesis protein RibF  28.1 
 
 
336 aa  58.2  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  28.38 
 
 
313 aa  58.2  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2214  riboflavin biosynthesis protein RibF  26.67 
 
 
313 aa  57.8  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00156337  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11510  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  28.47 
 
 
290 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00384201  normal  0.587346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1066  riboflavin biosynthesis protein RibF  28.37 
 
 
315 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  0.0219323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14650  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  26.17 
 
 
313 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5114  riboflavin biosynthesis protein RibF  25 
 
 
314 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2195  normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5827  riboflavin biosynthesis protein RibF  25.17 
 
 
310 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2129  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  26.43 
 
 
317 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23420  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  26.39 
 
 
329 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.119836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0782  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  26.53 
 
 
317 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0759  riboflavin biosynthesis protein RibF  31.29 
 
 
310 aa  50.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.776079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
790 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07060  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  28.17 
 
 
325 aa  48.9  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  25.69 
 
 
314 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  25.34 
 
 
333 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0510646  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3505  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  25.33 
 
 
314 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3326  riboflavin biosynthesis protein RibF  27.4 
 
 
313 aa  47.8  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0873807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1435  riboflavin biosynthesis protein RibF  27.15 
 
 
327 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2437  riboflavin biosynthesis protein RibF  28.38 
 
 
325 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1430  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  27.15 
 
 
327 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  28.08 
 
 
529 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7738  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  27.03 
 
 
320 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1022  riboflavin biosynthesis protein RibF  25.35 
 
 
315 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07880  FMN adenylyltransferase;riboflavin kinase  26.14 
 
 
307 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2557  riboflavin biosynthesis protein RibF  26.39 
 
 
320 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1337  riboflavin biosynthesis protein RibF  24.49 
 
 
309 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107929  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0907  riboflavin biosynthesis protein RibF  27.86 
 
 
324 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10360  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  26.67 
 
 
338 aa  45.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_52223  riboflavin kinase  29.1 
 
 
150 aa  45.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3585  riboflavin biosynthesis protein RibF  23.61 
 
 
315 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1379  riboflavin biosynthesis protein RibF  24.49 
 
 
309 aa  44.7  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.672568  normal  0.471041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  26.06 
 
 
314 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1654  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  27.97 
 
 
309 aa  44.3  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1936  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  27.97 
 
 
309 aa  44.3  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2234  riboflavin biosynthesis protein RibF  28.26 
 
 
317 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2189  riboflavin biosynthesis protein RibF  28.08 
 
 
314 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000130005  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3260  riboflavin biosynthesis protein RibF  27.92 
 
 
356 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0245  riboflavin biosynthesis protein RibF  25.17 
 
 
314 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.694964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2151  riboflavin biosynthesis protein RibF  26.39 
 
 
330 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1843  riboflavin biosynthesis protein RibF  25.97 
 
 
316 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18679  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0492  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  24.05 
 
 
315 aa  42  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.196365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3184  riboflavin biosynthesis protein RibF  26.71 
 
 
311 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.516481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2123  riboflavin biosynthesis protein RibF  23.13 
 
 
322 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4052  riboflavin biosynthesis protein RibF  28.86 
 
 
313 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0480  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  26.67 
 
 
355 aa  41.2  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2118  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  25.32 
 
 
352 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  29.61 
 
 
312 aa  41.2  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3662  riboflavin biosynthesis protein RibF  27.89 
 
 
309 aa  40.8  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1061  riboflavin biosynthesis protein RibF  27.89 
 
 
317 aa  40.8  0.01  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  27.27 
 
 
322 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>