12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31130 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_66748  ATP-dependent DNA helicase  72.17 
 
 		 2159 aa  3190    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31130  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 2115 aa  4424    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31131  ATP-dependent DNA helicase  72.17 
 
 		 2159 aa  3190    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31132  ATP-dependent DNA helicase  82.13 
 
 		 1572 aa  1786    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33212  ATP-dependent DNA helicase  97.68 
 
 		 2110 aa  4233    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33214  predicted protein  72.22 
 
 		 451 aa  675    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33612  Vesicle coat complex AP-3  88.56 
 
 		 2116 aa  3864    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_27987  vesicle coat complex AP-3  87.47 
 
 		 2116 aa  3815    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.643082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_27988  vesicle coat complex AP-3  87.38 
 
 		 1323 aa  2391    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_27989  ATP-dependent DNA helicase  84.73 
 
 		 669 aa  1162    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67724  predicted protein  30.65 
 
 		 381 aa  158  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579873  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05092  telomere-associated RecQ helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14720)  26.04 
 
 		 1571 aa  45.8  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.154319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>