13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46947 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46947  predicted protein  100 
 
 
452 aa  942    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44300  predicted protein  39.41 
 
 
603 aa  280  5e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38757  predicted protein  39.18 
 
 
559 aa  271  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0269601  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36628  predicted protein  40.48 
 
 
469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0161158  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46621  predicted protein  39.82 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.483384  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44206  predicted protein  38.64 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45942  predicted protein  39.44 
 
 
519 aa  213  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.617552  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49890  predicted protein  33.43 
 
 
811 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.146051  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49891  predicted protein  33.43 
 
 
798 aa  157  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48077  predicted protein  32.7 
 
 
444 aa  151  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00714324  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43128  predicted protein  28.68 
 
 
476 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48336  predicted protein  37.65 
 
 
188 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48335  predicted protein  58.54 
 
 
152 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>