12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48336 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48336  predicted protein  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38757  predicted protein  56.19 
 
 
559 aa  235  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0269601  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44300  predicted protein  52.84 
 
 
603 aa  193  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45942  predicted protein  37.91 
 
 
519 aa  117  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.617552  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46947  predicted protein  37.65 
 
 
452 aa  110  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46621  predicted protein  34.15 
 
 
472 aa  90.5  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.483384  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36628  predicted protein  33.54 
 
 
469 aa  89.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0161158  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44206  predicted protein  32.93 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49890  predicted protein  25.15 
 
 
811 aa  58.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.146051  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49891  predicted protein  25.15 
 
 
798 aa  58.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48077  predicted protein  25.15 
 
 
444 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00714324  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43128  predicted protein  27.1 
 
 
476 aa  41.2  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>