37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_52200 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_52200  predicted protein  100 
 
 
73 aa  136  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47268  predicted protein  53.73 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  39.19 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  38.03 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.44 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  51.02 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
88 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  38.03 
 
 
71 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
95 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
88 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.15 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  40.35 
 
 
83 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.22 
 
 
96 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  40.82 
 
 
90 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  32.88 
 
 
91 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  32.88 
 
 
91 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  37.1 
 
 
122 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  36.92 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.33 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  32.88 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.22 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.18 
 
 
193 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  33.82 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  40 
 
 
76 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10686  Tat family transporter: pH-dependent thylakoid protein export into thylakoid  56.1 
 
 
55 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.57 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  35.85 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.22 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  31.25 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  48.57 
 
 
112 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.86 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  30.88 
 
 
91 aa  41.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  35.29 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  34.92 
 
 
57 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>