10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47314 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47314  Spc97  100 
 
 
1274 aa  2632    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.477788  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35149  predicted protein  27.86 
 
 
704 aa  233  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721723  normal  0.0346434 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05873  Gamma-tubulin complex protein 2 (Eurofung)  27.56 
 
 
875 aa  228  6e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748248  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02860  gamma-tubulin complex component 2 (gcp-2), putative  25.49 
 
 
909 aa  202  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.448332  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31283  predicted protein  22.83 
 
 
748 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0962472  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00810  gamma-tubulin complex component 3 (gcp-3), putative  22.31 
 
 
856 aa  107  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04867  Gamma-tubulin complex protein 3 (Eurofung)  23.31 
 
 
968 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375952 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44333  Spc98  24.91 
 
 
843 aa  99.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54133  predicted protein  20.45 
 
 
844 aa  89  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.510859  normal  0.869225 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08120  Gamma-tubulin complex protein 5 (Eurofung)  26.25 
 
 
905 aa  45.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0472782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>