12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA02860 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA02860  gamma-tubulin complex component 2 (gcp-2), putative  100 
 
 
909 aa  1871    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.448332  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05873  Gamma-tubulin complex protein 2 (Eurofung)  40.46 
 
 
875 aa  543  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748248  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35149  predicted protein  29.27 
 
 
704 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721723  normal  0.0346434 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47314  Spc97  26.09 
 
 
1274 aa  207  8e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.477788  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54133  predicted protein  23.47 
 
 
844 aa  160  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.510859  normal  0.869225 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31283  predicted protein  22.83 
 
 
748 aa  118  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0962472  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04867  Gamma-tubulin complex protein 3 (Eurofung)  22.68 
 
 
968 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375952 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00810  gamma-tubulin complex component 3 (gcp-3), putative  22.39 
 
 
856 aa  99  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44333  Spc98  20.7 
 
 
843 aa  87.4  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14999  predicted protein  20.93 
 
 
634 aa  73.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08120  Gamma-tubulin complex protein 5 (Eurofung)  23.16 
 
 
905 aa  61.6  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0472782 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32821  predicted protein  24.5 
 
 
914 aa  52.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.441662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>