12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44333 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44333  Spc98  100 
 
 
843 aa  1735    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31283  predicted protein  27.27 
 
 
748 aa  233  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0962472  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04867  Gamma-tubulin complex protein 3 (Eurofung)  27.37 
 
 
968 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375952 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00810  gamma-tubulin complex component 3 (gcp-3), putative  29.35 
 
 
856 aa  176  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35149  predicted protein  22.09 
 
 
704 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721723  normal  0.0346434 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47314  Spc97  24.91 
 
 
1274 aa  110  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.477788  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05873  Gamma-tubulin complex protein 2 (Eurofung)  22.49 
 
 
875 aa  104  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.748248  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02860  gamma-tubulin complex component 2 (gcp-2), putative  20.97 
 
 
909 aa  97.4  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.448332  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14999  predicted protein  23.65 
 
 
634 aa  96.7  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60226  spindle pole body component  19.68 
 
 
799 aa  85.9  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112974  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08120  Gamma-tubulin complex protein 5 (Eurofung)  22.9 
 
 
905 aa  61.2  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0472782 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32821  predicted protein  22.26 
 
 
914 aa  60.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.441662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>