19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44398 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44398  predicted protein  100 
 
 		 760 aa  1570    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.160536  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36323  predicted protein  58.99 
 
 		 452 aa  567  1e-160  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000954555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6287  ABC transporter related protein  31.49 
 
 		 264 aa  54.7  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  23.92 
 
 		 263 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  30.91 
 
 		 248 aa  45.8  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0281  ABC transporter related  45.16 
 
 		 250 aa  45.8  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00633179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 252 aa  45.8  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3123  ABC transporter-related protein  25 
 
 		 251 aa  45.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2257  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  24.43 
 
 		 506 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1771  ABC transporter related  26.14 
 
 		 229 aa  45.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  37.8 
 
 		 252 aa  45.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0699  ABC transporter-related protein  30.6 
 
 		 286 aa  45.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.011362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2207  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.03 
 
 		 416 aa  45.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000444837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  37.35 
 
 		 252 aa  45.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0886  ABC transporter, ATP-binding protein  20.72 
 
 		 291 aa  45.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00203373  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  36.62 
 
 		 265 aa  44.7  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  26.94 
 
 		 343 aa  44.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  24.57 
 
 		 263 aa  44.3  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4364  ABC transporter-like  25 
 
 		 246 aa  44.3  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>