27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43446 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43446  predicted protein  100 
 
 
747 aa  1554    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31465  predicted protein  33.72 
 
 
580 aa  103  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0521  methyltransferase, putative  36.27 
 
 
209 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0906024  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0216  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  35.71 
 
 
224 aa  56.6  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.500451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1443  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.37 
 
 
207 aa  55.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0955  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.17 
 
 
207 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000977838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3034  putative methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417573  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0119  hypothetical protein  26.99 
 
 
240 aa  51.2  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0118328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2778  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.43 
 
 
207 aa  51.2  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0134218  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11630  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.98 
 
 
301 aa  50.8  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.353819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1047  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.42 
 
 
219 aa  50.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715174  normal  0.315052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0761  methyltransferase, putative  31.37 
 
 
232 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.88261e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2910  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.46 
 
 
215 aa  48.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3371  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.4 
 
 
230 aa  47.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_25292  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  40 
 
 
775 aa  47.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.025628 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  28.57 
 
 
219 aa  47.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.31883  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18760  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.63 
 
 
331 aa  47  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.404471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5326  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.65 
 
 
234 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3592  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.69 
 
 
229 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010395  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4479  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.83 
 
 
272 aa  46.6  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3782  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.97 
 
 
319 aa  45.8  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3140  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  27.22 
 
 
259 aa  45.8  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7016  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.2 
 
 
239 aa  45.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.774499  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2026  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.43 
 
 
223 aa  44.3  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0277  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  24.49 
 
 
198 aa  44.3  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000164749  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3237  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.77 
 
 
230 aa  44.3  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0366  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.76 
 
 
267 aa  43.9  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.133582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>