13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20332 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_20332  predicted protein  100 
 
 
326 aa  678    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00427  conserved hypothetical protein  33.99 
 
 
362 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.773109  normal  0.443001 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37559  predicted protein  35.29 
 
 
345 aa  153  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.960018  normal  0.136249 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12544  predicted protein  37.69 
 
 
258 aa  143  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211036  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  25.86 
 
 
311 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  25.44 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  27 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  27 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  24.54 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  24.16 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  23.74 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  25.93 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  26.49 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>